基础研究
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世界华人消化杂志. 2019-06-28; 27(12): 734-741
Published online 2019-06-28. doi: 10.11569/wcjd.v27.i12.734
基于Oncomie和Kaplan-Meier Plotter数据库分析KLF5在胃癌中的表达及其与患者预后相关性
冯福梅, 张磊
冯福梅, 张磊, 天津市宝坻区人民医院胃肠外科 天津市 301800
冯福梅, 主治医师, 主要从事胃肠外科及消化道肿瘤研究.
作者贡献分布: 此课题由张磊设计; 研究过程由冯福梅操作完成; 数据分析由冯福梅完成; 本论文写作由冯福梅与张磊共同完成.
通讯作者: 张磊, 主治医师, 301800, 天津市宝坻区南关大街53号, 天津市宝坻区人民医院胃肠外科. ymd24c@163.com
电话: 022-29241700
收稿日期: 2019-03-21
修回日期: 2019-05-28
接受日期: 2019-06-17
在线出版日期: 2019-06-28
Abstract
背景

胃癌(gastric cancer, GC)为临床上常见的消化系统肿瘤, 确诊时大多为晚期患者预后不良, 且临床上缺乏预后预测相关因子.

目的

应用Oncomie和Kaplan-Meier Plotter数据库分析Kruppel样因子5(kruppel-like factor 5, KLF5)在GC中的表达及其与患者预后相关性.

方法

收集Oncomie和Kaplan-Meier Plotter数据库中关于KLF5基因表达的相关数据集, 深入挖掘KLF5基因在GC组织与正常胃组织中的差异表达情况, 根据KLF5中位表达水平分为高表达组和低表达组, 绘制生存曲线并用Log-rank检验比较KLF5高、低表达组患者总生存及无疾病进展生存是否存在差异. 同时回顾性分析天津市宝坻区人民医院收治并手术治疗的41例GC患者的临床资料, 采用免疫组化检测41例患者癌组织中KLF5表达情况, 探讨KLF5表达与患者临床病理特征的关系.

结果

Oncomine数据库共收录了424个关于KLF5基因表达水平的相关研究, 其中在癌组织vs正常组织中差异表达的有35个, 与正常组织相比, 8个数据集结果提示KLF5在癌组织中高表达, 27个数据集在癌组织中低表达. 聚类分析显示, KLF5与ST14, TMEM125等20个基因存在共表达情况(在GC中共同低表达或高表达), 提示这些共表达基因在功能上可能存在相关性. Oncomine数据库中10个KLF5表达芯片数据集对比分析了GC组织与正常组织中KLF5基因的差异表达情况, 其中有4个芯片数据提示了GC组织中KLF5表达水平明显升高. Kaplan-Meier Plotter数据库中, 2个相关基因芯片数据分析了KLF5表达与GC患者预后的关系, Long-rank检验显示KLF5高表达患者总生存和无疾病进展生存均小于低表达组(P<0.05). 免疫组化分析显示41例GC患者中, KLF5阳性表达者29例, 阳性率为70.7(29/41). KLF5阳性表达与患者临床病理特征如性别、年龄、肿瘤分期、分级等无明显相关性(P>0.05).

结论

KLF5在GC中高表达并与患者的不良预后有关, 而KLF5表达与患者临床病理特征无关.

Keywords: 胃癌; KLF5基因; Oncomine数据库; 预后

核心提要: 本文通过分析Oncomie和Kaplan-Meier Plotter数据库Kruppel样因子5(kruppel-like factor 5, KLF5)在胃癌(gastric cancer, GC)中的表达及其与患者预后相关性, 同时采用免疫组织化学方法证实KLF5在GC中高表达并与患者的不良预后有关, 提示KLF5可作为GC预后的潜在生物学分子标记物.