基础研究
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世界华人消化杂志. 2015-10-28; 23(30): 4816-4821
Published online 2015-10-28. doi: 10.11569/wcjd.v23.i30.4816
Piezo1蛋白的生物信息学分析及其在肠道中的表达
白涛, 钱伟, 张磊, 汪欢, 侯晓华, 宋军
白涛, 钱伟, 张磊, 汪欢, 侯晓华, 宋军, 华中科技大学同济医学院附属协和医院消化科 湖北省武汉市 430022
白涛, 博士, 主要从事功能性胃肠病的临床与基础研究.
基金项目: 国家自然科学基金资助项目, No. 81200271.
作者贡献分布: 此课题由宋军与侯晓华设计; 生物信息学分析由白涛与汪欢完成; 免疫组织化学与RT-PCR由钱伟与张磊完成; 论文写作由白涛完成.
通讯作者: 宋军, 副主任医师, 430022, 湖北省武汉市解放大道1277号, 华中科技大学同济医学院附属协和医院消化科. song111jun@126.com
收稿日期: 2015-08-10
修回日期: 2015-09-21
接受日期: 2015-09-25
在线出版日期: 2015-10-28
Abstract

目的: 预测分析Piezo1理化性质和结构等, 并检测其在肠道的表达.

方法: 利用Protparam程序预测Piezo1蛋白基本理化性质; 利用ProtComp Version 9.0分析亚细胞定位; 利用SOPMA程序预测其二级结构; 利用SWISS-MODEL服务器生成其三维模型. 利用免疫组织化学方法检测Piezo1在肠道组织的表达及定位, 以实时定量PCR检测(real-time quantitative PCR)检测Piezo1在不同肠段的表达量.

结果: Piezo1蛋白分子量为286.6453 kDa, 等电点pI = 7.27. Piezo1蛋白多次跨膜, 并有多个转录后蛋白修饰位点. Piezo1蛋白表达于肠道上皮与神经节, 其在结肠表达含量较回肠丰富(P<0.01).

结论: Piezo1在肠道表达丰富, 在肠上皮功能和肠道感觉调控方面的可能有关键作用.

Keywords: 机械门控离子通道; Piezo1; 肠神经; 肠上皮

核心提示: 本文利用生物信息学工具, 对Piezo1蛋白理化性质、分子结构、生物学功能进行预测分析, 并运用实验室方法检测其在肠道组织中的表达, 以期为进一步探讨Piezo1蛋白特性和功能、开发药物等提供理论依据, 为Piezo1蛋白在肠道功能和肠道疾病中的作用进行相关性的研究中奠定基础.