GATA5和Vimentin基因启动子甲基化在结直肠癌患者粪便中的检测及临床意义

表1 GATA5和Vimentin基因甲基化特异性PCR引物序列

基因	Primer	片段 (5'-3')	退火温度 (℃)	扩增长度(bp)
GATA5	M	F: 5'-TTAGAAATCGAGGAAATCGC-3'	54	133
		R: 5'-GTAAACCCCCTCGTTACGTA-3'
	U	F: 5'-TGTTTAGAAATTGAGGAAATTGT-3'	48	133
		R: 5'-CCCATAAACCCCCTCATTACATA-3'
Vimentin	M	F: 5'-AGGAAAGTATAAATTTCGGGTGC-3'	52	173
		R: 5'-ATAAACGACGTCTTTCACCCTTAC-3'
	U	F: 5'-AAAAGGAAAGTATAAATTTTGGGTGT-3'	48	173
		R: 5'-TATAAACAACATCTTTCACCCTTACCT-3'

M: 甲基化; U: 非甲基化; F: 上游引物; R: 下游引物. GATA5: GATA结合蛋白5. Vimentin: 波形蛋白.

表2 CRC基因甲基化与临床病理特征相关性 n1/n(%)

特征	n	GATA5	Vimentin	Combined
CRC	49	40/49(81.6)	22/49(44.9)	47/49(95.1)
性别
男	20	16/20(80.0)	7/20(35.0)	19/20(95.0)
女	29	24/29(82.8)	15/29(51.7)	28/29(96.6)
P值		1.0	0.25	1.0
年龄(岁)
≤50	9	8/9(88.9)	5/9(55.6)	9/9(1.0)
>50	40	32/40(80.0)	17/40(42.5)	38/40(95.0)
P值		1.0	0.71	1.0
TNM 分期
I/II期	26	19/26(73.1)	12/26(46.2)	24/26(92.3)
III/IV期	23	21/23(91.3)	10/23(43.5)	23/23(1.00)
P值		0.15	0.85	0.49
肿瘤位置
直肠	33	24/33(72.7)	16/33(48.5)	31/33(93.9)
右结肠	5	5/5(1.0)	2/5(40.0)	5/5(1.0)
左结肠	11	11/11(1.0)	4/11(36.4)	11/11(1.0)
P值		0.07	0.76	0.60
正常样本	37	5/37(13.5)	5/37(13.5)	10/37(27.0)

CRC: 结直肠癌. GATA5: GATA结合蛋白5. Vimentin: 波形蛋白.

表3 粪便样本中基因甲基化检测的敏感性和特异性及OR值[%(95%CI)]

基因	敏感性	特异性	OR值	P值
GATA5	81.63(67.98-91.24)	86.49(71.23-95.46)	28.44(8.67-93.33)	<0.01
Vimentin	44.90(30.67- 59.77)	86.49(71.2- 95.46)	5.22(1.74-15.64)	<0.01
联合检测	95.92(86.02-99.50)	72.97(55.88-86.21)	63.45(12.93-311.3)	<0.01

GATA5: GATA结合蛋白5. Vimentin: 波形蛋白.