临床经验
Copyright ©The Author(s) 2014. Published by Baishideng Publishing Group Inc. All rights reserved.
世界华人消化杂志. 2014-02-18; 22(5): 690-694
Published online 2014-02-18. doi: 10.11569/wcjd.v22.i5.690
应用SELDI-TOF-MS技术筛选肝癌遗传性血清蛋白标志物
邓敬桓, 陈智平, 李山, 秦雪, 黄东萍
邓敬桓, 陈智平, 黄东萍, 广西医科大学公共卫生学院 广西壮族自治区南宁市 530021
李山, 秦雪, 广西医科大学第一附属医院检验科 广西壮族自治区南宁市 530021
邓敬桓, 助理研究员, 硕士, 主要从事肝病蛋白组学的研究.
基金项目: 广西自然科学基金资助项目, No. 2011GXNSFA018271.
作者贡献分布: 论文写作与质谱分析由邓敬桓完成; 课题设计由陈智平完成; 试剂由秦雪提供; 数据分析由李山与黄东萍完成.
通讯作者: 陈智平, 教授, 硕士生导师, 530021, 广西壮族自治区南宁市双拥路22号, 广西医科大学公共卫生学院. nanyangtang@yahoo.com.cn
电话: 0771-5358877
收稿日期: 2013-12-06
修回日期: 2013-12-30
接受日期: 2014-01-08
在线出版日期: 2014-02-18
Abstract

目的: 采用表面增强激光解析/电离飞行时间质谱技术(surface enhanced laser desorption inhibition time of flight ionization mass spectrometry, SELDI-TOF-MS)检测肝癌易发家系患者和无癌家系患者血清蛋白生物标志物, 比较两者间的蛋白差异, 建立筛选血清蛋白质图谱模型并初步验证.

方法: 选择30例肝癌易发家系患者, 30例无癌家系患者, 应用SELDI-TOF-MS技术及相应的计算机软件进行比较分析, 检测肝癌易发家系患者血清蛋白质的特异性生物标志, 建立肝癌易发家系患者的筛选模型, 并对其进行了双盲法验证.

结果: 肝癌易发家系组与对照组共有20个蛋白质差异有显著性, 以其中4个蛋白标志物(9645.48、3960.65、7895.66和5916.07 kDa), 建立的筛选模型检测灵敏度为93%(28/30), 特异性为90%(27/30), 准确率为92%(55/60). 盲法验证, 灵敏度为92%(23/25), 特异性为90%(18/20).

结论: SELDI-TOF-MS技术具有高灵敏度和特异性, 在肝癌易发家系的血清蛋白特异性生物标志物的筛选等方面具有较好的应用前景.

Keywords: 肝癌; 家系; 表面加强激光解吸电离-飞行时间质谱; 血清蛋白标志物

核心提示: 本研究筛选出的20个有统计学意义的差异性蛋白峰可能就是我们要寻找的遗传性蛋白质峰, 肝癌易发家系组与无癌家系组在血清蛋白组学方面确实存在差异, 再次验证原发性肝癌的发生与遗传具有密切相关性.