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世界华人消化杂志. 2009-12-18; 17(35): 3601-3605
Published online 2009-12-18. doi: 10.11569/wcjd.v17.i35.3601
Published online 2009-12-18. doi: 10.11569/wcjd.v17.i35.3601
溃疡性结肠炎与肠应激综合征间差异基因表达
陈玉龙, 吕翠田, 河南中医学院 河南省郑州市 450008
苗艳艳, 广州中医药大学 广东省广州市 510405
陈玉龙, 副教授, 主要从事中医药分子生物学研究.
作者贡献分布: 本文相关研究有陈玉龙主持设计; 陈玉龙、苗艳艳及吕翠田共同进行了相关生物信息学研究, 本论文写作由陈玉龙与苗艳艳共同完成.
通讯作者: 陈玉龙, 副教授, 博士, 450008, 河南省郑州市金水路1号, 河南中医学院基础医学院. cyl72621@163.com
电话: 0371-65680049
收稿日期: 2009-07-07
修回日期: 2009-09-24
接受日期: 2009-10-12
在线出版日期: 2009-12-18
修回日期: 2009-09-24
接受日期: 2009-10-12
在线出版日期: 2009-12-18
Abstract
目的: 观察溃疡性结肠炎(UC)和肠易激综合征(IBS)之间基因表达上的差异, 从基因水平探讨UC的病理机制及其与IBS的区别.
方法: 从GEO下载UC和IBS基因芯片资料, 用BRB-ArrayTools 3.6软件对该数据进行挖掘, 并对差异表达基因进行生物信息学分析.
结果: 两者具有131条差异基因, 涉及炎症反应、免疫、信号传导、细胞外分泌、基因转录调节、细胞结构、细胞死亡等. 与IBS 相比, UC上调基因124条, 下调基因7条. 聚类分析发现, 两类样品可根据基因表达进行区分.
结论: 与IBS相比, UC肠黏膜在炎症、分泌、细胞生长和增殖等的相关基因表达增高; 利用基因芯片能够对两种疾病进行区别.
Keywords: 溃疡性结肠炎; 肠易激综合征; 基因芯片; 数据挖掘