基础研究
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世界华人消化杂志. 2009-05-28; 17(15): 1508-1512
Published online 2009-05-28. doi: 10.11569/wcjd.v17.i15.1508
幽门螺杆菌动物模型驯化菌株SS1与其初始菌株的差异蛋白质组分析
李晶, 赵飞, 肖迪, 何利华, 张建中
李晶, 赵飞, 肖迪, 何利华, 张建中, 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所 北京市 102206
李晶, 在读博士, 主要从事幽门螺杆菌黏附相关因素的研究.
基金项目: "十一五"国家科技支撑计划重点基金资助项目, No. 2007BAI04B02.
作者贡献分布: 本研究由李晶与张建中设计; 实验过程由李晶、赵飞、肖迪及何利华共同完成; 蛋白鉴定由李晶与肖迪完成; 数据分析由李晶与赵飞完成; 本论文写作由李晶与张建中完成.
通讯作者: 张建中, 研究员, 102206, 北京市, 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所. helico99@sina.com
电话: 010-61739456 传真: 010-61730233
收稿日期: 2009-03-02
修回日期: 2009-04-09
接受日期: 2009-04-13
在线出版日期: 2009-05-28
Abstract

目的: 比较H pylori动物模型适应菌株SS1与其初发菌株10700间蛋白质组差异, 试图获得H pylori在小鼠体内适应过程中可能与定植能力增强相关的蛋白特征.

方法:  在相同件下培养SS1菌株及其初始菌株, 并制备全菌蛋白样品, 相同实验条件下重复3次, 样品经二维电泳分离, 扫描获得数字化的电泳胶图像并用ImageMaster2D图像分析软件比较分析, 识别SS1与初始菌株间的差异蛋白点. 取3次制备的样品间的共同差异点进行胶内酶解, 经基质辅助激光电离解析飞行时间质谱(MALDI-TOF-TOF/MS)获得肽质量指纹图谱, 用Mascot软件在Swiss-Prot和NCBI数据库中搜索匹配蛋白.  

结果: 表达量有明显下降的11个点, 经鉴定对应10个蛋白: 4个属于H pylori的氧化还原系统, 即过氧化氢酶、超氧化物双歧酶、硫氧环蛋白和环氧蛋白还原酶; 5个蛋白与代谢有关, 即脯氨酸肽酶(proline peptidase)、果糖磷酸氢盐醛缩酶(fructose-bisphosphate aldolase)、无机焦磷酸酶(inorganic pyrophosphatase)、3-含氧酸辅酶A转移酶亚单位B(3-oxoacid CoA-transferase subunit B)和延伸因子(elongation factor P); 另1个蛋白为假想蛋白HPAG0942.

结论:  H pylori在小鼠体内的定植适应过程中, 伴有代谢酶表达的降低和抗氧化水平的减弱, 提示代谢和抗氧化能力适度下调可能与菌株的定植力增强相关.

Keywords: 幽门螺杆菌; 动物模型; 二维电泳; 基质辅助激光解析电离飞行时间质谱