临床研究
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世界华人消化杂志. 2007-11-28; 15(33): 3500-3506
Published online 2007-11-28. doi: 10.11569/wcjd.v15.i33.3500
基因芯片技术检测西藏拉萨地区的乙型肝炎病毒基因型
曹占良, 高英堂, 刘霜, 景丽, 吉宗, 刘彤, 刘持佳, 杜智
曹占良, 刘持佳, 武警医学院附属医院检验科 天津市 300162
高英堂, 景丽, 刘彤, 杜智, 天津市第三中心医院 天津市人工细胞重点实验室 天津市 300170
刘霜, 天津市人民医院检验科 天津市 300120
吉宗, 武警西藏总队医院检验科 西藏自治区拉萨市 850000
曹占良, 2002年第三军医大学本科毕业, 学士学位, 副主任技师. 主要从事免疫、生化检验工作.
基金项目: 天津市科委攻关项目, No. 05YFSZSF02500; 武警医学院院级科研基金项目, No. WY2004-15.
通讯作者: 高英堂, 300170, 天津市河东区津塘路83号, 天津市第三中心医院. gaoyt816@163.com
电话: 022-84112148
收稿日期: 2007-08-09
修回日期: 2007-10-30
接受日期: 2007-10-28
在线出版日期: 2007-11-28
Abstract

目的: 研研究西藏拉萨地区乙型肝炎病毒基因型的分布与特点.

方法: 采集92份西藏拉萨地区乙型肝炎患者的血清, 参照GenBank中HBV DNA序列设计寡核苷酸探针并制备HBV基因分型芯片, 利用套式PCR扩增HBV S基因部分片段, 结合基因芯片、DNA测序和BioEdit软件进行基因分型检测, 并对其与乙肝标志物、DNA含量、性别和民族之间的关系进行分析.

结果: 在92例血清标本中, 套式PCR检测73例HBV DNA阳性可进行基因分型检测, 其中B型13例(17.8%), C型18例(24.7%), D型39例(53.4%)和B/D混合基因型3例(4.1%). 统计学分析3种基因型分布在不同乙肝标志物阳性、不同DNA含量和不同性别之间无差异, 但与民族存在统计学差异(χ2 = 7.179, P<0.05). B型以汉族为主(9/13), 而C、D型以藏族为主(12/18、28/39). 将基因芯片分型的B、C、D型和B/D混合型进行DNA序列分析, 表明两种分型方法的结果完全一致.

结论: PCR结合基因芯片技术可用于HBV基因分型. 西藏拉萨地区HBV基因型包括B、C、D和B/D混合型, 其中以D型为主.

Keywords: 乙型肝炎病毒; 基因型; 基因芯片; 序列分析