病毒性肝炎
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世界华人消化杂志. 2004-07-15; 12(7): 1569-1573
Published online 2004-07-15. doi: 10.11569/wcjd.v12.i7.1569
HBV前-S1蛋白结合蛋白大鼠同源基因的克隆化
成军, 董菁, 张健, 王建军, 纪冬, 刘妍, 钟彦伟, 王琳
成军, 董菁, 张健, 王建军, 纪冬, 刘妍, 钟彦伟, 王琳, 中国人民解放军第302医院传染病研究所基因治疗研究中心 北京市 100039
成军, 男, 1963-08-17生, 山东省淄博市人, 汉族. 1994年北京医科大学传染病学博士, 1994年美国得克萨斯大学健康科学中心临床免疫与传染病科博士后. 教授, 主任医师, 博士生导师, 出版专著5部, 发表论文400篇. 中华医学会传染病与寄生虫病学分会副主任委员.
基金项目: 国家自然科学基金攻关项目, No. C03011402, No. C30070689, No. C39970674, No. C30371288; 军队九五科技攻关项目, No. 98D063; 军队回国留学人员启动基金项目, No. 98H038; 军队十五科技攻关青年基金项目, No. 01Q138; 军队十五科技攻关项目, No. 01MB135.
通讯作者: 成军, 100039, 北京市西四环中路100号, 中国人民解放军第302医院传染病研究所基因治疗研究中心、全军病毒性肝炎防治研究重点实验室. cj@genetherapy.com.cn
电话: 010-66933391 传真: 010-63801283
收稿日期: 2004-02-14
修回日期: 2004-04-10
接受日期: 2004-05-11
在线出版日期: 2004-07-15
Abstract

目的: 利用生物信息学(bioinformatics)技术克隆, 鉴定人HBsAg前-S1蛋白结合蛋白(PS1BP)编码基因的同源基因.

方法: 人PS1BP由表达型cDNA文库的噬菌体展示技术筛选获得. 以人的PS1BP的cDNA序列作为参照, 对于美国国立卫生研究院(NIH)国立医学图书馆(NLM)生物工程信息学研究中心(NCBI)建立的核苷酸序列数据库GenBank, 利用同源基因序列比对的在线分析软件BLASTn进行同源基因序列的比对, 发现新的来源于大鼠的同源基因. 确定大鼠PS1BP的cDNA序列之后, 对于大鼠PS1BP蛋白质一级结构序列与人和小鼠的PS1BP蛋白质一级结构序列的同源性进行分析. 利用在线分析软件, 对于大鼠PS1BP一级结构序列中潜在的修饰和功能位点进行初步的预测分析.

结果: 利用噬菌体展示技术获得了人的PS1BP的cDNA序列. 以生物信息学技术确定了大鼠PS1BP的cDNA及其编码产物的序列. 大鼠PS1BP的cDNA由1 455 nt组成, 编码产物由484 aa组成. 大鼠PS1BP蛋白质一级结构与人和小鼠PS1BP蛋白质一级结构的同源性分别为80.79%(391/484)和92.98%(450/484). 利用在线分析软件, 在大鼠PS1BP蛋白质一级结构中还发现了一系列潜在的蛋白质修饰结构位点.

结论: 大鼠PS1BP基因及其编码产物序列被确定.

Keywords: N/A