病毒性肝炎
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世界华人消化杂志. 2004-01-15; 12(1): 42-46
Published online 2004-01-15. doi: 10.11569/wcjd.v12.i1.42
乙型肝炎病毒基因组高变区界定的初步研究
董菁, 成军, 杨倩
董菁, 成军, 杨倩, 中国人民解放军第302医院传染病研究所基因治疗研究中心、全军病毒性肝炎防治研究重点实验室 北京市 100039
董菁, 男, 1969-02-07生, 河北省徐水县人, 汉族, 2001年北京大学医学部毕业, 医学博士, 主治医师, 主要学术研究方向: 乙型肝炎病毒分子生物学与病毒性肝炎的治疗.
基金项目: 国家自然科学基金资助项目, No. C30070690, C39970674, C03011402; 归国留学人员科研启动基金资助项目, No. 98H038.
通讯作者: 成军, 北京市, 100039, 中国人民解放军第302医院传染病研究所基因治疗研究中心、全军病毒性肝炎防治研究重点实验室. cj@genetherapy.com.cn
电话: 010-66933391 传真: 010-63801283
收稿日期: 2003-06-25
修回日期: 2003-07-01
接受日期: 2003-07-16
在线出版日期: 2004-01-15
Abstract

目的: 探讨乙型肝炎病毒(HBV)基因组是否存在高保守区或高变区, 并探讨前-前-S基因和前-X基因的存在方式.

方法: 自GenBank中按血清型搜索符合要求的HBV全基因组序列, 并应用Vector 6.0版软件进行核苷酸序列同源性的分析和比较.

结果: GenBank中搜索出28个adr血清型和22个adw血清型HBV病毒株全基因组, 比较后发现2种血清型的核苷酸序列总一致率分别为76.6%和73.9%; adr血清型病毒株存有高度变异区和高度变异区, 一致率分别为54.5%和92.1%; adw血清型基因组内部含有高度保守区, 一致率为85.0%, 不含有高度变异区. 前-前-S区的存在是较为普遍的现象, 而前-X区的编码具有adr血清型特异性特点, 在某些病毒基因组中, 因为存在A2608 →C/T和C/A2733 →T替换突变, 导致其前-X基因编码区起始密码子突变, 因此部分HBV基因组无前-X基因结构区.

结论: HBV基因组内部可能存在高度保守区, 前-前-S区的存在是一个重要的现象, 而前-X编码区具有adr血清型特异性的特点.

Keywords: N/A