临床研究
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世界华人消化杂志. 2016-06-08; 24(16): 2485-2491
在线出版 2016-06-08. doi: 10.11569/wcjd.v24.i16.2485
表1 引物序列表
基因名称引物序列
PRKCD上游: 5'-CCTGACTATATCGCCCCTGA-3'
下游: 5'-GTCCTTGGACTCCTTGGTGA-3'
PIK3R1上游: 5'-AGCATTGGGACCTCACATTACACA -3'
下游: 5'-ACTGGAAACACAGTCCATGCACATA-3'
PTPRC上游: 5'-AGCACCCTGAGACCCTACC-3'
下游: 5'-TGAAATGCCTTAATCCCCTT-3'
FOXO3上游: 5'-GCAAAGCAGACCCTCAAACTG-3'
下游: 5'-TGAGAGCAGATTTGGCAAAGG-3'
STAT3上游: 5'-ACCTGCAGCAATACCATTGAC-3'
下游: 5'-AAGGTGAGGGACTCAAACTGC-3'
GNAI2上游: 5'-GCCTACTACCTGAACGACCT-3'
下游: 5'-ATGATGGACGTGTCTGTGAACC-3'
表2 表达下调差异表达基因的信号通路
信号通路基因P
ErbB通路EREG、PIK3R1、SOS2、AKT3、CBL0.029282
非小细胞肺癌通路STK4、PIK3R1、SOS2、AKT30.029282
mTOR通路PIK3R1、AKT3、RHEB、RICTOR0.029282
RNA降解通路DDX6、PAPOLA、DIS3、TTC370.030507
T细胞受体信号通路PIK3R1、SOS2、AKT3、CBL、PTPRC0.037193
慢性白血病信号通路PIK3R1、SOS2、AKT3、CBL0.037765
肾细胞癌信号通路PIK3R1、SOS2、AKT3、ETS10.037765
表3 表达上调差异表达基因的信号通路
信号通路基因P
趋化因子信号通路STAT1、GNB2、GNAI2、GRK6 NCF1、HCK、STAT3、FOXO3、PRKCD、ARRB1、ADCY3、JAK30.000616
溶酶体信号通路CTSA、CTSD、PSAP、AP3D1 ATP6V0D1、CTSB、AP1M10.030655
霍乱弧菌感染信号通路ACTB、ARF1、ADCY3、ATP6V0D1、ATP6V0E10.030655
IgG Fc受体介导的吞噬作用通路PRKCD、INPP5D、NCF1、HCK ARPC4、SPHK10.032924

引文著录: 宁文锋, 王芳, 邓宏军, 陈宏辉. 慢性乙型肝炎患者的差异表达基因筛选及相关信号通路预测. 世界华人消化杂志 2016; 24(16): 2485-2491