基础研究
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世界华人消化杂志. 2021-06-08; 29(11): 577-584
Published online 2021-06-08. doi: 10.11569/wcjd.v29.i11.577
TACC3基因在肝癌中的表达及其与患者的预后关系
邢国强, 运涛, 赵国刚
邢国强, 运涛, 赵国刚, 天津市第五中心医院普外科 天津市 300450
邢国强, 住院医师, 研究方向为普通外科.
作者贡献分布: 此课题由邢国强设计,数据统计和文章撰写,研究过程和数据统计由运涛共同完成; 赵国刚负责最终的审较.
通讯作者: 赵国刚, 副主任医师, 300450, 天津市滨海新区浙江路41号, 天津市第五中心医院普外科. tjsdwzxyyzgg@163.com
收稿日期: 2021-02-22
修回日期: 2021-04-05
接受日期: 2021-05-11
在线出版日期: 2021-06-08
Abstract
背景

转录相关酸性卷曲蛋白3 (transforming acidic coiled coil protein 3, TACC3)是TACC家族的重要成员, 研究表明, TACC3基因在乳腺癌, 非小细胞肺癌, 胃癌中高表达, 并与预后较差有关. 但是其在肝癌中的表达情况及与患者预后的关系鲜见报道.

目的

通过生物信息学手段探讨TACC3基因在肝癌中的表达及其与患者的预后关系.

方法

分别检索BioGPS、Oncomine、癌症细胞系百科全书(cancer cell line encyclopedia, CCLE)数据库, 挖掘分析TACC3基因在正常人体组织、肝癌组织及肝癌细胞系中的表达情况, 应用 Kaplan-Meier Plotter、GEPIA等数据库分析TACC3基因对肝癌患者预后的影响.

结果

BioGPS数据库分析结果显示TACC3基因在人体各组织中均有表达, 肝脏组织中的表达值中位数略高于其他正常组织(8.95 vs 7.1). 从Oncomine数据库检索出TACC3基因相关研究290项, 显示肝癌组织中TACC3基因高表达4项, 低表达1项, Meta分析显示与正常肝组织相比TACC3基因在肝癌组织中呈高表达状态[中位秩(Median Rank) = 442.5, P<0.05]. CCLE数据库分析显示, 在肝癌细胞系中TACC3 mRNA高表达. Kaplan-Meier Plotter及GEPIA数据库生存分析结果显示, TACC3基因高表达组的肝癌患者总体生存时间(OS)和无进展生存时间(PFS)等生存预后指标均较低表达组差(P<0.05).

结论

TACC3基因在肝癌组织中呈高表达, 且TACC3基因高表达与肝癌患者生存预后差有关.

Keywords: 肝癌; 生物信息学; TACC3基因

核心提要: 转录相关酸性卷曲蛋白3 (transforming acidic coiled coil protein 3, TACC3)是TACC家族的重要成员, 本研究通过生物信息学手段证实TACC3基因在肝癌中呈高表达, 并且其高表达与肝癌患者生存预后差有关.