基础研究
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世界华人消化杂志. 2016-04-08; 24(10): 1492-1500
Published online 2016-04-08. doi: 10.11569/wcjd.v24.i10.1492
沉默MCM7基因后肝癌SMMC-7721细胞差异表达基因的筛选
罗旺, 曹骥, 杨香娣, 邓玲, 王谷洋, 杨春, 李科志, 李瑗
罗旺, 曹骥, 杨香娣, 邓玲, 王谷洋, 杨春, 李科志, 李瑗, 广西医科大学附属肿瘤医院实验研究部 广西壮族自治区南宁市 530021
罗旺, 杨香娣, 邓玲, 王谷洋, 广西医科大学研究生学院 广西壮族自治区南宁市 530021
罗旺, 主要从事肝癌病因学、发病机制方面的研究.
基金项目: 国家自然科学基金资助项目, No. 81260080; 广西自然科学基金资助项目, No. 2013GXNSFAA019210.
作者贡献分布: 此课题由曹骥设计; 研究过程由罗旺、杨香娣、邓玲、王谷洋、杨春、李科志及李瑗操作完成; 数据分析和论文写作由罗旺与曹骥共同完成.
通讯作者: 曹骥, 研究员, 530021, 广西壮族自治区南宁市青秀区双拥路22号, 广西医科大学附属肿瘤医院实验研究部. caojicn@163.com
电话: 0771-5310593
收稿日期: 2016-01-11
修回日期: 2016-02-23
接受日期: 2016-02-29
在线出版日期: 2016-04-08
Abstract

目的: 探究微小染色体维持蛋白7(mini-chromosome maintenance protein 7, MCM7)基因在调节肝癌细胞生长的相关机制.

方法: 通过siRNA干扰技术沉默人肝癌SMMC-7721细胞中的MCM7基因表达, 采用人全基因组表达谱芯片, 筛查MCM7沉默后差异表达基因, 进行生物信息学分析, 并对部分差异表达基因进行蛋白免疫印迹法(Western blot)验证.

结果: 芯片筛选出在人肝癌SMMC-7721细胞中沉默MCM7基因后差异表达基因1010个, 其中上调基因391个, 下调基因619个. 这些基因主要涉及生物大分子代谢、细胞周期调控、细胞增殖、细胞凋亡等方面, 参与胞吞、肿瘤相关通路、P53信号通路、mTOR信号通路等通路的改变. Western blot对部分差异基因表达验证的结果显示CCND1、SKP2和JUP蛋白表达均下调, 与芯片检测结果一致.

结论: 应用人基因表达谱芯片, 成功筛选出沉默MCM7基因后人肝癌细胞SMMC-7721差异表达基因, 为探究MCM7基因影响肝癌细胞生长提供了有效线索.

Keywords: 肝癌; MCM7; RNA干扰; 人基因表达谱芯片

核心提示: 本研究通过筛选沉默MCM7基因后人肝癌细胞SMMC-7721中差异表达的基因, 发现差异表达基因涉及肿瘤相关通路、细胞周期通路等信号通路, 经Western blot证实了CCND1、SKP2、JUP等蛋白差异表达, 为揭示MCM7基因影响肝癌细胞生长的作用机制提供了新的思路.