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世界华人消化杂志. 2012-10-18; 20(29): 2789-2794
Published online 2012-10-18. doi: 10.11569/wcjd.v20.i29.2789
Published online 2012-10-18. doi: 10.11569/wcjd.v20.i29.2789
基于iTRAQ结合质谱筛选HBV肝纤维化的差异表达蛋白
张维维, 吕小平, 广西医科大学第一附属医院西院消化内科 广西壮族自治区南宁市 530021
何晓, 李茵, 李翠萍, 广西医科大学公共卫生学院 广西壮族自治区南宁市 530021
李洪涛, 罗蓉, 何敏, 广西医科大学医学科学实验中心 广西壮族自治区南宁市 530021
张维维, 在读硕士, 主要从事肝纤维化疾病的研究.
基金项目: 国家自然科学基金资助项目, No. 30960332; 广西医科大学医学科学实验中心开放基金资助项目, No. KFJJ2010-45.
作者贡献分布: 张维维、何敏及吕小平对此文所做贡献均等; 此课题由张维维、何敏及吕小平共同设计; 研究过程由张维维、何晓、李茵及李翠萍操作完成; 研究所用新试剂及分析工具由李洪涛与罗蓉提供; 数据分析由张维维与何晓完成; 本文写作由张维维与何敏共同完成.
通讯作者: 何敏, 教授, 530021, 广西壮族自治区南宁市双拥路22号, 广西医科大学实验中心. m_h_m868@sina.com
电话: 0771-5358634 传真: 0771-5350975
收稿日期: 2012-08-09
修回日期: 2012-09-26
接受日期: 2012-10-08
在线出版日期: 2012-10-18
修回日期: 2012-09-26
接受日期: 2012-10-08
在线出版日期: 2012-10-18
Abstract
目的: 采用核素标记相对和绝对定量(isobaric rags for relative and absolute quantitation, iTRAQ)蛋白组学技术分析乙型肝炎病毒(hepatitis B virus, HBV)肝纤维化患者和健康人血清中的差异表达蛋白.
方法: 肝纤维患者与正常人血清各30例, 去除血清中14种高丰度蛋白, 运用液相色谱基质辅助激光解析/电离-飞行时间质谱技术(matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-fight mass spectrometry, MALDI-TOF-MS)筛选并鉴定差异表达蛋白, 并对差异表达蛋白进行生物学分析.
结果: 共鉴定血清蛋白274个, 符合条件的差异蛋白20个. 其中, 在肝纤维患者血清中有11个蛋白表达上调, 7个蛋白表达下调. 20种差异表达蛋白参与48种生物学过程、8种细胞组分和12种分子途径; 蛋白功能交互网图显示APOC3、CLU、C4B、CRP和APOE在网图中处于功能网络交叉点.
结论: 处于差异蛋白功能交互网中交叉点位置的载脂蛋白C-Ⅲ(apolipoprotein C-Ⅲ, APOC3)、聚集素(clusterin, CLU)、补体C4B(complement C4-B, C4B)、C-反应蛋白(c-reactive protein, CRP)、载脂蛋白E(apolipoprotein E, APOE), 可能在HBV肝纤维化的发生发展过程中发挥重要作用.
Keywords: 肝纤维化; HBV; iTRAQ; 血清标志物; 蛋白组学