Copyright
©The Author(s) 2012. Published by Baishideng Publishing Group Inc. All rights reserved.
世界华人消化杂志. 2012-08-18; 20(23): 2218-2223
Published online 2012-08-18. doi: 10.11569/wcjd.v20.i23.2218
Published online 2012-08-18. doi: 10.11569/wcjd.v20.i23.2218
幽门螺杆菌上皮接触诱导基因iceA1的克隆及序列特征
邵长江, 连云港市第二人民医院消化科 江苏省连云港市 222006
张尤历, 陈慧娟, 孔梅, 陈鑫, 宋永站, 江苏大学附属医院消化科 江苏省镇江市 212001
王文兵, 江苏大学生命科学研究院 江苏省镇江市 212013
邵长江, 硕士, 主治医师, 主要从事幽门螺杆菌与消化系统疾病研究.
作者贡献分布: 邵长江与张尤历对此文所作贡献均等; 此课题由张尤历与王文兵共同设计; 研究过程由邵长江、陈慧娟、孔梅、陈鑫及宋永站操作完成; 研究所用新试剂及分析工具由张尤历提供; 分析由邵长江完成; 本论文写作由邵长江完成.
通讯作者: 张尤历, 教授, 212001, 江苏省镇江市解放路438号, 江苏大学附属医院消化科. zjyouli@yahoo.com.cn
电话: 0511-85011787
收稿日期: 2012-05-23
修回日期: 2012-06-29
接受日期: 2012-08-01
在线出版日期: 2012-08-18
修回日期: 2012-06-29
接受日期: 2012-08-01
在线出版日期: 2012-08-18
Abstract
目的: 克隆和分析镇江地区来源于不同疾病的(胃癌、溃疡和胃炎)幽门螺杆菌(Helicobacter pylori, H. pylori)的表皮接触诱导基因iceA1.
方法: 从胃十二指肠疾病患者胃黏膜组织中分离培养获得H. pylori, PCR扩增检测iceA1基因, 并克隆至pMD18-T载体上, 进行测序和序列分析.
结果: 克隆和测序了镇江地区来源于不同疾病的(胃癌、溃疡和胃炎)共12株H. pylori的iceA1基因片段, 并与标准菌株60190比对, 结果显示镇江地区的H. pylori的iceA1基因中存在着3处框内缺失突变热点(780del6、809del5、914del7), 这些缺失突变在溃疡和胃炎中均存在, 但是胃癌株只存在809del5. 对缺失片段周围的序列进行分析, 这些缺失序列的两端基本都与同向重复序列相连, 这可能与复制过程中滑动错配的小片段缺失模型有关.
结论: iceA1序列的变异性有可能作为分析H. pylori群体遗传学的有用工具.
Keywords: 幽门螺杆菌; 上皮接触诱导基因; 克隆; 序列分析; 分子标记