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世界华人消化杂志. 2010-09-28; 18(27): 2929-2933
Published online 2010-09-28. doi: 10.11569/wcjd.v18.i27.2929
Published online 2010-09-28. doi: 10.11569/wcjd.v18.i27.2929
基因芯片技术对结直肠癌相关基因SNPs位点的相关性分析
邹江, 张国梁, 姚宏昌, 谭东毅, 天津第一中心医院 天津市 300192
作者贡献分布: 此课题由姚洪昌指导; 邹江设计; 研究过程由邹江、张国梁及谭东毅操作完成; 数据分析由邹江完成; 本论文写作由邹江与谭东毅完成.
通讯作者: 邹江, 主任医师, 300192, 天津市, 天津第一中心医院消化科. ericzou@yahoo.com.cn
电话: 022-23626816
收稿日期: 2010-07-06
修回日期: 2010-08-02
接受日期: 2010-08-10
在线出版日期: 2010-09-28
修回日期: 2010-08-02
接受日期: 2010-08-10
在线出版日期: 2010-09-28
Abstract
目的: 探讨结直肠癌(CRC)相关基因的单核苷酸多态性(SNPs)位点与结直肠癌(CRC)发生发展的关联性.
方法: 对20例CRC患者和30例正常对照组血液标本进行DNA提取、PCR扩增及SNPs芯片测序分析, 检测选定的同CRC发病关系较为密切的8个基因中的12个SNPs位点, 对其实验结果进行分析, 判断各位点与CRC的关联性.
结果: MTRR-01、CYP19A1-09与CRC之间有较强的关联性(P<0.05); 连锁不平衡(LD)分析发现, CYP19A1-09、CYP19A1-06、CYP19A1-14、CYP19A1-01存在强LD(D'>0.75), 其SNPs位点之间有明确的相关性.
结论: 本研究发现2个SNPs位点与CRC发病有密切联系, 应用SNPs芯片技术研究CRC相关基因是一种简便、快捷的方法.
Keywords: 结直肠肿瘤; 多态性, 单核苷酸; 寡核苷酸序列分析