临床经验
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世界华人消化杂志. 2009-09-28; 17(27): 2840-2845
Published online 2009-09-28. doi: 10.11569/wcjd.v17.i27.2840
乙型肝炎病毒大S蛋白基因纵向研究方法及应用
余南, 崔进, 周国宝, 张云娇, 陈晶砺
余南, 崔进, 周国宝, 张云娇, 陈晶砺, 广州开发区医院生物中心实验室 广州开发区医院传染科 广东省广州市 510730
基金项目: 广州市医药卫生科技基金资助项目, No. 2006-YB-196.
作者贡献分布: 此课题由余南设计; 研究过程由余南、崔进、周国宝、张云娇及陈晶砺完成; 研究所用试剂及分析工具由余南提供; 数据分析由余南与崔进完成; 论文写作由余南完成.
通讯作者: 余南, 博士, 510730, 广东省广州市广州经济技术开发区友谊路196号, 广州开发区医院生物中心实验室. yunan86@126.com
收稿日期: 2009-07-20
修回日期: 2009-09-05
接受日期: 2009-09-15
在线出版日期: 2009-09-28
Abstract

目的: 建立乙型肝炎病毒(HBV)大S蛋白基因纵向研究方法, 并将其应用于疾病进程中HBV的准种动态研究.

方法: 以2例HBV感染者(对象A, 男, 38岁; 对象B, 女, 22岁. 对象A研究期间未经任何抗病毒治疗, B则1年持续接受ADV抗病毒药物治疗)体内不同时期的血清样本核酸提取物为模板, 通过特异性扩增获取病毒大S蛋白基因序列并克隆测序, 依据生物信息学方法对发生于序列结构不同区域的变异进行分析, 利用比对数据对不同样本HBV准种予以描述与评价.

结果: 所得24条HBV大S蛋白基因序列中2条源于对象B样本的基因序列PreS2编码区存在30 nt的缺失, 其余22条序列大小均为1203 bp; 24条序列的HBV基因型均为C型. 对象A大S蛋白基因序列分散值DA、DB、DC分别为: 0.29、0.16、0.23, 对象B则为0.80、2.30、1.82. 来自对象A的全部10条HBV大S蛋白基因序列内部的"a"决定簇与参考基因完全一致; 对象B的14条序列期初有2条(29%)期终有6条(86%)存在G145R突变, 期终序列中有1条序列"a"决定簇内发现4个位点的突变.

结论: 人体内感染HBV以准种形式存在且可以用分散值DA、DB、DC对其进行描述, 并应用于HBV准种动态的纵向研究. 而抗病毒药物ADV的1年期治疗可使本例HBV准种分散性增高, 可能增加本例耐药性突变出现的风险, 同时增加本例"a"决定簇的变异出现.

Keywords: 乙型肝炎病毒; 大S蛋白; 变异; "a"决定簇; 准种