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胃癌中高表达ATP/GTP结合蛋白1基因的筛选及验证
张宇川, 张尤历, 陆芬英, 江苏大学附属医院消化科 江苏省镇江市 212001
王文兵, 高广, 江苏大学生命科学院 江苏省镇江市 212001
作者贡献分布: 此课题由张宇川, 张尤历, 王文兵策划设计; 课题实验由张宇川, 高广及陆芬英操作完成; 研究所用新试剂及分析工具由王文兵提供; 本论文写作由张宇川和高广完成.
通讯作者: 张尤历, 212001, 江苏省镇江市解放路438号, 江苏大学附属医院消化科. zjyouli@yahoo.com.cn
电话: 0511-85011787 传真: 0511-85011787
收稿日期: 2007-11-04
修回日期: 2008-02-16
接受日期: 2008-02-20
在线出版日期: 2008-03-08
修回日期: 2008-02-16
接受日期: 2008-02-20
在线出版日期: 2008-03-08
Abstract
目的: 探讨胃癌中差异表达的基因在胃癌发生和发展的分子机制中的作用.
方法: 提取胃癌组织样本的总RNA, 通过荧光差异显示技术(DD-PCR)获得胃癌样品中差异的片段, 对这些片段进行克隆和测序. 通过在GenBank中同源性检索, 查找与差异片段相对应的同源基因. 利用半定量PCR及定量PCR方法验证该基因表达的差异性.
结果: 通过DD-PCR得到差异片段中的一个片段对应与人ATP/GTP结合蛋白1基因(A/GTPBP1). 半定量PCR及荧光定量PCR技术检测结果表明, A/GTPBP1基因在胃癌组织中的表达量高于其对应的癌旁组织. 该基因的读码框长3561 bp, 编码1186个氨基酸, 分子质量为84.4 kDa, 蛋白质相似性分析表明该蛋白为G蛋白家族成员.
结论: A/GTPBP1在胃癌组织中异常高表达, 可能在胃癌发生过程中起调节作用.
Keywords: 荧光差异显示; 定量聚合酶链反应; 胃癌; ATP/GTP结合蛋白1基因