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世界华人消化杂志. 2007-04-28; 15(12): 1342-1346
Published online 2007-04-28. doi: 10.11569/wcjd.v15.i12.1342
Published online 2007-04-28. doi: 10.11569/wcjd.v15.i12.1342
视黄酸诱导蛋白16蛋白质结构功能分析
王阁, 邓婧, 杨进, 郑继军, 王红中, 胡庆, 张志敏, 陈川, 王东, 第三军医大学大坪医院野战外科研究所肿瘤中心 重庆市 400042
李增鹏, 第三军医大学大坪医院野战外科研究所病理科 重庆市 400042
王阁, 第三军医大学博士研究生, 副教授, 主要从事肝细胞肝癌的分子机制研究.
基金项目: 国家自然科学基金资助项目, No. 30570410, No. 30370341; 全国优秀博士专项基金资助项目, No. 200261.
通讯作者: 王阁, 400042, 重庆市, 第三军医大学大坪医院野战外科研究所肿瘤中心. wangge70@hotmail.com
电话: 023-68757756
收稿日期: 2007-02-05
修回日期: 2007-02-10
接受日期: 2007-02-13
在线出版日期: 2007-04-28
修回日期: 2007-02-10
接受日期: 2007-02-13
在线出版日期: 2007-04-28
Abstract
目的: 分析Tec激酶区作用蛋白视黄酸诱导蛋白16 (RAI16)的蛋白质结构和功能信息.
方法: 利用相应的计算机软件及数据库,对RAI16 cDNA序列进行分析和比较,并对编码的蛋白质氨基酸序列及其二级结构进行分析和预测.
结果: RAI16 cDNA序列由2863个核苷酸组成,编码759氨基酸蛋白质, RAI16蛋白包括一段由31个氨基酸组成的信号肽, 没有跨膜区, 亚细胞定位于内质网上, 有多种二级结构形式,为一紧密包裹的球状蛋白质, 是一种分泌蛋白, 有多个磷酸化和蛋白酶切位点. RAI16蛋白为不稳定蛋白, 不稳定系数为53.11, 疏水性GRAVY (grand average of hydropathicity)值为-0.136.
结论: RAI16蛋白作为一种新的胞内信号蛋白, 很可能在肝癌细胞的诱导分化信号转导转录中与Tec协同发挥重要作用.
Keywords: Tec蛋白; 视黄酸诱导蛋白16; 核苷酸; 蛋白质结构