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基因芯片筛选肝硬化相关基因
黄海涛, 广州军区武汉总医院消化内科 湖北省武汉市 430070
林菊生, 余爽, 马昕, 华中科技大学同济医学院附属同济医院肝病研究所 湖北省武汉市 430030
通讯作者: 林菊生, 430030, 湖北省武汉市, 华中科技大学同济医学院附属同济医院肝病研究所. linjusheng2001@163.net
电话: 027-83662578 传真: 027-83662578
收稿日期: 2004-04-28
修回日期: 2004-05-20
接受日期: 2004-06-24
在线出版日期: 2004-08-15
修回日期: 2004-05-20
接受日期: 2004-06-24
在线出版日期: 2004-08-15
Abstract
目的: 应用基因芯片技术研究肝硬化相关基因的基因表达谱.
方法: 乙肝肝硬化组织为实验组, 以正常肝组织为对照. 按一步法抽提实验组和对照组标本的总RNA并纯化mRNA; 将等量的实验组和对照组标本mRNA分别逆转录合成荧光分子掺入的cDNA做探针,混合后杂交1 568点BioDoorChipLiver-16S芯片.经严格洗片后用ScanArray3000扫描仪扫描芯片获取荧光信号图像,计算机分析后比较两种组织中差异表达的基因.
结果: 在1 568种基因中, 肝硬化组织与正常肝组织间存在差异表达的基因. 所检测的3例临床标本中, 2例共有的差异表达基因66-76条(4.2%-4.8%),3例共有的差异表达基因28条(1.8%). 其中包含有与细胞外基质降解相关的基因, 与细胞生长因子有关的基因, 与信号传导有关的基因等.
结论: 应用基因芯片技术筛选肝硬化相关基因有助于阐明肝硬化发展机制.
Keywords: N/A