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大鼠短间隔连续部分肝切除中再生肝的基因表达差异
徐存拴, 韩鸿鹏, 袁金云, 常翠芳, 杨柯金, 赵利峰, 河南师范大学生命科学学院 河南省新乡市 453002
李文强, 李玉昌, 张会勇, 章静波, 细胞分化调控国家重点实验室培育基地 河南省新乡市 453002
Salman Rahman, 伦敦大学血友病研究中心 英国伦敦市 SE17EH
徐存拴, 男, 1958-02-02生, 河南省林州市人, 汉族. 1995年德国Bremen大学博士毕业, 教授. 主要从事细胞分化和去分化机制研究.
基金项目: 国家自然科学基金资助项目 , No. 30270673 ; 国家重点实验室基金资助项目 , No. 030001 .
通讯作者: 徐存拴, 453002, 河南省新乡市建设路148号, 河南师范大学生命科学学院. xucs@x263.com.cn
电话: 0373-3326001/3326609 传真: 0373-3326524
收稿日期: 2003-10-28
修回日期: 2003-11-25
接受日期: 2003-12-08
在线出版日期: 2004-03-15
修回日期: 2003-11-25
接受日期: 2003-12-08
在线出版日期: 2004-03-15
Abstract
目的: 鉴定0-36-40-44 h大鼠短间隔连续部分肝切除(0-36-40-44 h SISPH)中与肝再生有关的基因, 并分析他们在肝再生中的表达动态和作用.
方法: 从0-36-40-44h SISPH再生肝消减cDNA文库中筛选与肝再生有关的基因, 用基因芯片技术分析其在肝再生中的表达动态, 并用GeneMath软件对有关基因进行聚类分析.
结果: 用基因芯片技术分析的551个与肝再生有关基因中, 157个基因至少在肝再生的一个时间点表达变化达2倍以上, 其中, 上调表达的基因有87个, 下调表达的基因有70个; 157个基因中的71个属未报道的基因, 86个为已报道基因, 但在此之前尚不清楚他们与肝再生有关; 聚类分析和统计学分析表明, 0-36-40-44 h SISPH的基因表达模式分为6类, 即早期诱导, 中期诱导, 晚期诱导, 早期抑制, 中期抑制, 晚期抑制. 与PH相比, 38个基因在0-36-40-44 h SISPH中特异性表达, 119个基因在这两个模型中表达趋势相同, 但在各时间点的表达丰度不同.
结论: 0-36-40-44 h SISPH中, 上调和下调表达的基因数目相差不大; 晚期表达的基因多于早期表达的基因, 远多于中期表达的基因; 表达幅度小的基因(2-5倍)多于表达幅度大的基因.
Keywords: N/A