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肠癌大鼠与正常大鼠粪便菌群的结构性差异
高仁元, 朱庆超, 伍雯, 上海交通大学附属第六人民医院普外科 上海市 200233
秦环龙, 同济大学附属第十人民医院普外科 上海市 200072
高仁元, 上海交通大学医学院在读硕士研究生, 主要从事胃肠病学的研究.
基金项目: 国家自然科学基金资助项目, No. 81230057; 上海市科学技术委员会基金资助项目, No. 11140902400.
作者贡献分布: 此课题由高仁元与朱庆超设计; 实验操作由朱庆超与伍雯完成; 数据分析及论文撰写由高仁元完成; 秦环龙指导.
通讯作者: 秦环龙, 教授, 博士生导师, 200072, 上海市闸北区延长中路301号, 同济大学附属第十人民医院普外科. huanlqin@126.com
电话: 021-64361349
收稿日期: 2013-10-22
修回日期: 2013-12-16
接受日期: 2013-12-19
在线出版日期: 2014-02-18
修回日期: 2013-12-16
接受日期: 2013-12-19
在线出版日期: 2014-02-18
Abstract
目的: 研究结肠癌大鼠与正常大鼠粪便菌群结构性变化.
方法: 通过1, 2-二甲肼(dimethyl hydrazine, DMH)腹腔注射构建大肠癌的动物模型, 造模成功后收集实验组和对照组大鼠肠道粪便, 利用PCR-DGGE(polymerase chain reaction- denaturing gradient electrophoresis)技术分离菌群, 对两组菌群相似性(聚类分析)和多态性(丰富度、均一性、Shannon-Wiener指数、Simpson指数)进行分析, 并对目的菌群与GenBank进行比对, 确定菌群种属, 研究其变化规律.
结果: 相较于对照组, 实验组中毛螺菌科(Lachnospiraceae)、Ruminococcaceae科菌、肠乳杆菌(Lactobacillus intestinalis)、帕拉普氏菌属(Paraprevotella)、鼠乳杆菌(Lactobacillus murinus)、乳杆菌属(Lactobacillus)、普氏菌属(Prevotella)、卷曲乳杆菌(Lactobacillus crispatus)和Lachnospiracea incertae sedis等菌群丰度显著降低, 而粪芽孢菌属(Coprobacillus)丰度则明显增加. 尽管两组菌群多样性均较丰富, 但菌群结构相似性存在明显差异.
结论: 肠癌大鼠与正常对照组相比出现粪便菌群结构的偏移, 有益菌减少, 潜在致病菌增加.
Keywords: 肠癌; PCR; DGGE; 聚类分析; 菌群
核心提示: 与正常大鼠相比, 肠癌大鼠粪便中菌群发生明显偏移, 有益菌数量及种类明显下降, 而致病菌却增加.