病毒性肝炎
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世界华人消化杂志. 2003-04-15; 11(4): 394-398
Published online 2003-04-15. doi: 10.11569/wcjd.v11.i4.394
丙型肝炎病毒核心蛋白结合蛋白6基因转染肝癌细胞的基因表达谱芯片分析
刘妍, 成军, 李克, 杨倩, 陆荫英, 王琳, 王建军
刘妍, 成军, 李克, 杨倩, 陆荫英, 王琳, 王建军, 中国人民解放军第302医院传染病研究所基因治疗研究中心, 全军病毒性肝炎防治研究重点实验室北京市 100039
刘妍, 女, 1973-01-15生, 辽宁海城市人, 满族. 1995年北京医科大学本科毕业, 军事医学科学院免疫学专业2002级硕士研究生, 助理研究员, 主要从事病毒性肝炎基础研究.
基金项目: 国家自然科学基金资助项目, No. C39970674; No. C03011402; 归国留学人员科研启动基金资助项目, No. 98H038.
通讯作者: 成军, 100039, 北京市丰台路26号, 中国人民解放军第302医院传染病研究所基因治疗研究中心, 全军病毒性肝炎防治研究重点实验室. cj@genetherapy.com.cn
电话: 010-66933391传真: 010-63801283
收稿日期: 2002-10-29
修回日期: 2002-11-15
接受日期: 2002-11-28
在线出版日期: 2003-04-15
Abstract
目的

筛选并克隆丙型肝炎病毒(HCV)核心蛋白的肝细胞结合蛋白基因, 并对新基因转染肝癌细胞的基因表达谱进行分析, 探索该基因表达对肝细胞基因表达的调节机制.

方法

应用酵母双杂交技术, 以HCV的核心蛋白作为"诱饵(bait)", 筛选鉴定与其结合的肝细胞中蛋白的编码基因. 应用生物信息学(bioinformatics)技术, 分析其中筛选得到的人HCV核心蛋白结合蛋白6(HCBP6)基因的全长编码序列, 并构建HCBP6基因的真核表达载体pcDNA3. 1(-)-HCBP6. 应用基因表达谱芯片技术对重组表达质粒pcDNA3. 1(-)-HCBP6转染的HepG2细胞和空载体处理的相同细胞差异表达的mRNA进行检测.

结果

通过酵母双杂交技术的筛选和鉴定, 结合生物信息学分析, 确定人的HCBP6基因由456nt组成, 编码152aa的蛋白. 基因表达谱芯片所检测的1152条目的基因均为GenBank中登录的基因, HCBP6表达质粒转染的细胞有20条差异表达基因, 其中13条基因表达增强, 7条基因表达降低. 这些差异表达的基因与细胞信号转导、增生、分化及生长调节密切相关.

结论

酵母双杂交技术结合生物信息学技术, 是克隆蛋白结合蛋白的有效方法, 基因表达谱芯片技术对于初步全面探索新基因的功能提供重要的资料. 本实验结果为进一步阐明HCV核心蛋白与Hcbp6相互作用后的肝细胞生物大分子变化提供了理论依据.

Keywords: N/A