Association of human leukocyte antigen DQB1 and DRB1 alleles with chronic hepatitis B

Table 1 List of primers used in the study

DQB1 allele	Primers	PCR product	DRB1 allele	Primers	PCR product
DQB1*0501	5’ 5’ CGGAGCGCGTGCGGGG 3’	128	DRB1*01	5’ TTGTGGCAGCTTAAGTTTGAAT 3’	168
	3’ 5’ GCTGTTCCAGTACTCGGCAA 3’			5’ GCTGTTCCAGTACTCGGCAT 3’
DQB1*0502	5’ 5’ TGCGGGGTGTGACCAGAC 3’	117	DRB1*15/16	5’ TCCTGTGGCAGCCTAAGA G 3’	310
	3’ 5’ TGTTCCAGTACTCGGCGCT 3’			5’ CGCTGCACTGTGAAGCTCTC 3’
DQB1*0503	5’ 5’ TGCGGGGTGTGACCAGAC 3’	87	DRB1*03	5’ GTTTCTTGGAGTACTCTAGGTC 3’	222
	3’ 5’ GCGGCGTCACCGCCCGA 3’			5’ TGCAGTAGTTGTCCACCCG 3’
DQB1*0601	5’ 5’ GCCATGTGCTACTTCACCAAT 3’	198	DRB1*04	5’ GTTTCTTGGAGCAGGTTAAACA 3’	262
	3’ 5’ CACCGTGTCCAACTCCGCT 3’			5’ CGCTGCACTGTGAAGCTCTC 3’
DQB1*0602	5’ 5’ CGTGCGTCTTGTGACCAGAT 3’	121	DRB1*11	5’ CACGTTTCTTGGAGTACTCTAC 3’	179
	3’ 5’ GCTGTTCCAGTACTCGGCAT 3’			5’ CTGGCTGTTCCAGTACTCCT 3’
DQB1*0603	5’ 5’ GGAGCGCGTGCGTCTTGTA 3’	127	DRB1*12	5’ AGTACTCTACGGGTGAGTGTT 3’	198
	3’ 5’ GCTGTTCCAGTACTCGGCAT 3’			5’ CTGTTCCAGGACTCGGCGA 3’
DQB1*0604	5’ 5’ CGTGTACCAGTTTAAGGGCA 3’	254	DRB1*13/14	5’ GTTTCTTGGAGTACTCTACGTC 3’	234
	3’ 5’ GCAGGATCCCGCGGTACC 3’			5’ CGTAGTTGTGTCTGCA(GA)TAGG 3’
DQB1*0201	5’ 5’ GTGCGTATTGTGAGCAGAAG 3’	205	DRB1*07	5’ CCTGTGGCAGGG AAGTATA 3’	232
	3’ 5’ GCAAGGTCGTGCGGAGCT 3’			5’ CCCGTAGTTGTGTCTGCACAC 3’
DQB1*0201/0302	5’ 5’ GACGGAGCGCGTGCGTCT 3’	129	DRB1*08	5’ AGTACTCTACGGGTGAGTGTT 3’	227
	3’ 5’ CTGTTCCAGTACTCGGCGG 3’			5’ CCCGTATTGTGTCTGCAG 3’
DQB1*0301	5’ 5’ GACGGAGCGCGTGCGTTA 3’	122	DRB1*09	5’ GTTTCTTGAAGCAGGATAAGTTT 3’	236
	3’ 5’ AGTACTCGGCGTCAGGCG 3’			5’ CCCGTAGTTGTGTCTGCACAC 3’
DQB1*0302/0303	5’ 5’ GACGGAGCGCGTGCGTCT 3’	122	DRB1*10	5’ CGGTTGCTGGAAAGACGCG 3’	204
	3’ 5’ AGTACTCGGCGTCAGGCG 3’			5’ CTGCACTGTGAAGCT CTCAC 3’
DQB1*0303	5’ 5’ GACGGAGCGCGTGCGTCT 3’	129	DRB1-Exon2	5’ TTCGTGTCCCCACAGCACGTTTC 3’	295
	3’ 5’ CTGTTCCAGTACTCGGCGT 3’			5’ GCCGCTGCACTGTGAAGCTCTC 3’
DQB1*0401	5’ 5’ CACCAACGGGACCGAGCT 3’	200	Internal control (HGH)	5′ CAGTGCCTTCCCAACCATTCCCTTA 3′	439
	3’ 5’ GGTAGTTGTGTCTGCATACG 3’			5’ ATCCACTCACGGATTTCTGTTGTGTTTC 3′
DQB1*0402	5’ 5’ CACCAACGGGACCGAGCG 3’	200
	3’ 5’ GGTAGTTGTGTCTGCATACG 3’