肠癌大鼠与正常大鼠粪便菌群的结构性差异

表1 PCR引物

引物	序列	扩增片段大小
F357-GC	5'-CCCGCCGCGCCCCGCGCCCGGCCCGCCGCCCCCGCCCCCCTACGGGAGGCAGCAG-3'	230 bp
R518	5'-ATTACCGCGGCTGCTGG-3'

表2 两组大鼠粪便菌群丰度及多样性指数结果

多样性指数	实验组	对照组	P值
丰富度(S)	25.833±5.845	21.500±2.665	0.142
均一性(E)	1.000	1.000	-
Shannon-Wiener指数(H')	3.231±0.222	3.062±0.122	0.133
Simpson指数(D)	0.960±0.089	0.953±0.060	0.149

表3 代表性条带菌群鉴定结果

条带编号	菌群(门)	菌群(属)	种属相似性(%)	V3区大小(bp)
3	Spirochaetes	Treponema amylovorum	82	194
7	Firmicutes	unclassified_Ruminococcaceae	90	172
12	Firmicutes	Lactobacillus crispatus	93	193
16	Firmicutes	Coprobacillus1	95	193
18	Firmicutes	Lachnospiracea incertae sedis	97	168
20	Bacteroidetes	Prevotella	91	189
22	Firmicutes	Lactobacillus intestinalis	100	194
26	Bacteroidetes	Paraprevotella	100	188
27	Firmicutes	Lactobacillus murinus	100	194
35	Firmicutes	Lactobacillus	96	194

¹代表菌群在实验组中比例升高; 未标记代表实验组菌群比例降低.