基础研究
Copyright ©The Author(s) 2022.
世界华人消化杂志. 2022-05-08; 30(9): 402-410
在线出版 2022-05-08. doi: 10.11569/wcjd.v30.i9.402
表1 纳入分析的4个数据基本特征
数据集提交者地区种属标本
HCC正常合计
GSE62232Schulze[8]法国人类811091
GSE67764Yang[9]中国人类639
GSE89377Shen[10]韩国人类401353
GSE112790Shimada[11]日本人类18315198
表2 差异表达基因GO富集
GO基因数背景基因强度P value
生物学过程
铜离子解毒6142.37.37E-09
极低密度脂蛋白颗粒重塑392.190.00087
脂质羟基化272.120.0388
生物碱代谢过程272.120.0388
凋亡细胞的识别272.120.0388
细胞对铜离子的反应7272.083.68E-09
细胞对锌离子的反应6232.084.45E-08
对促红细胞生成素的反应282.070.0436
细胞对镉离子的反应83727.77E-10
细胞成分
转录因子ap-1复合物342.540.00078
高密度脂蛋白颗粒4291.810.00087
分子功能
过渡金属离子结合1310760.750.0013
类固醇羟化酶活性4361.710.0041
类固醇结合51041.350.0061
芳香化酶活性3241.770.0337
锌离子结合98110.710.0425
阳离子结合2142420.360.0425
雌激素2-羟化酶活性252.270.0425
表3 差异表达基因KEGG功能富集
KEGG富集基因数背景基因强度P value
细胞色素P450对外源性物质的代谢6691.615.45E-06
化学致癌6751.575.45E-06
矿物吸收5581.63.42E-05
药物代谢-细胞色素P4505641.564.06E-05
类固醇激素生物合成4591.50.0009
视黄醇代谢4641.460.001
亚油酸3291.680.0028
胆固醇代谢3481.460.0101

引文著录: 唐辉, 汪笑秋. 细胞色素P450家族成员CYP2E1, CYP3A4和CYP1A2表达与HCC发生有关并可作为HCC诊断和预后的分子标志物. 世界华人消化杂志 2022; 30(9): 402-410