表达谱测序筛选大肠癌colo205细胞及其来源的CD133+、CD133-细胞群肿瘤代谢相关基因

表1 Colo205细胞株来源细胞群表达谱原始测序数据统计

样本	原始数据统计结果			基因组mapping比率
	序列数(条)	碱基数(bp)	≥Q20(%)	序列数(条)	百分比(%)
CD133-	17722146	886107300	96.84	12915738	87.07
CD133+	23174152	1158707600	95.76	16118258	85.93
colo205	27260265	1363013250	95.92	19304605	84.11

表2 部分肿瘤代谢相关基因及其在colo205来源细胞群表达变化

代谢途径	靶基因	功能	基因表达变化			转录因子
			阳性/阴性	未分选/阴性	未分选/阳性
糖基转运	GLUT1	糖基转运	1.37	0.32	0.24	HIF/c-Myc/p53
	GLUT2	糖基转运	1.00	1.18	1.18	c-Myc
	GLUT3	糖基转运	0.56	0.51	0.90	HIF/p53
	GLUT4	糖基转运	0.92	1.75	1.92	c-Myc/p53
糖酵解	HK2	己糖磷酸化	0.91	1.39	1.52	HIF/c-Myc/p53
	ALDOA	醛缩酶	2.11	1.44	0.68	HIF/c-Myc
	GAPDH	3-P-甘油醛脱氢	1.84	1.86	1.01	HIF/c-Myc
	PGK1	磷酸甘油酸激酶	1.58	1.37	0.87	HIF/c-Myc
	PGM	磷酸甘油酸变位酶	1.72	1.20	0.70	p53
	ENO1	烯醇化酶	1.79	2.01	1.12	HIF/c-Myc
	PKM2	丙酮酸激酶	1.15	1.15	1.00	HIF/c-Myc
	LDHA	乳酸脱氢酶	2.42	1.97	0.82	HIF/c-Myc
	G6PDH	6-磷酸葡萄糖脱氢酶	1.16	1.62	1.39	p53
磷酸戊糖	TKT	转酮醇酶	1.20	0.90	0.75	HIF
	TKTL2	转酮醇酶样蛋白2	1.15	1.15	1.00	HIF
TCA循环	PDK1	丙酮酸脱氢酶激酶1	1.43	1.30	0.91	HIF/c-Myc
	GLS1	谷氨酰胺酶	0.54	0.53	0.99	c-Myc
	GLS2	谷氨酰胺酶	0.83	0.97	1.19	p53
	IDH1	异柠檬酸脱氢酶1	1.02	1.29	1.27	未知
	IDH2	异柠檬酸脱氢酶2	1.80	2.54	1.42	未知
	SCO2	细胞色素氧化酶	1.90	1.80	0.94	p53
合成代谢	CAD	氨甲酰磷酸合成酶	0.87	0.80	0.92	c-Myc
	SHMT	丝氨酸羟甲基转移酶	1.08	1.98	1.83	c-Myc
	FAS	脂肪酸合成	1.12	1.17	1.04	c-Myc
	ODC	鸟氨酸脱羧	0.81	1.43	1.75	c-Myc
	ACLY	ATP-柠檬酸裂解酶	0.88	1.18	1.33	未知

阳性/阴性: CD133⁺/CD133^-; 未分选/阴性: colo205/CD133^-; 未分选/阳性: colo205/CD133⁺. GLUT: 葡糖转移酶; HK2: 己糖磷酸化酶2; ALDOA: 果糖二磷酸醛缩酶A; GAPDH: 3-P-甘油醛脱氢酶; PGK1: 磷酸甘油酸激酶; PGM: 磷酸甘油酸变位酶; ENO1: 烯醇化酶; PKM2: 丙酮酸激酶; LDHA: 乳酸脱氢酶; G6PDH: 6-磷酸葡萄糖脱氢; TKT: 转酮醇酶; TKTL2: 转酮醇酶样蛋白2; PDK1: 丙酮酸脱氢酶激酶1; GLS1: 谷氨酰胺酶1; GLS2: 谷氨酰胺酶2; IDH1: 异柠檬酸脱氢酶1; IDH2: 异柠檬酸脱氢酶2; SCO2: 细胞色素氧化酶; CAD: 氨甲酰磷酸合成酶; SHMT: 丝氨酸羟甲基转移酶; FAS: 脂肪酸合成; ODC: 鸟氨酸脱羧酶; ACLY: ATP-柠檬酸裂解酶.

表3 部分肿瘤能量代谢调控相关蛋白基因及其在colo205来源细胞群表达变化

靶基因	参与调控代谢功能	基因表达变化
		阳性/阴性	未分选/阴性	未分选/阳性
p53	糖酵解/TCA循环/糖基转运	2.36	2.17	0.92
c-Myc	糖酵解/TCA循环/合成/糖基转运	1.43	1.27	0.87
HIF-1α	磷酸戊糖/TCA循环/糖酵解/糖基转运	0.51	0.67	1.30
HIF-2α	磷酸戊糖/TCA循环/糖酵解/糖基转运	1.08	0.89	0.82
RAS	糖酵解	1.49	1.78	1.19
RAF	糖酵解	0.81	0.85	1.04
MEK	糖酵解	1.36	1.27	0.93
ERK	糖酵解	1.39	1.99	1.44
LKB1	糖酵解	1.53	1.77	1.16
AMPK	糖酵解	0.94	0.38	0.40
mTOR	糖酵解	0.64	0.82	1.28
PI3K	糖酵解	0.71	1.12	1.57
AKT	糖酵解	1.52	1.68	1.11
VHL	糖酵解	0.61	0.88	1.44
TIGAR	糖酵解	1.40	1.38	0.98
CD44	糖酵解	1.78	1.20	0.67
PHD2	TCA循环	1.01	1.35	1.34
IKK	糖基转运	0.43	0.48	1.12
NF-κB	糖基转运	0.90	1.21	1.34
EGFR	糖基转运/糖酵解	0.73	0.54	0.74
PTEN	糖基转运/糖酵解	1.17	1.04	0.88
HER2	糖基转运/糖酵解	1.33	0.92	0.69
RTK6	糖酵解	1.07	0.60	0.56

HIF: 缺氧诱导因子; MEK: 细胞外信号调节激酶激酶; ERK: 细胞外调节蛋白激酶; LKB1: 肝脏激酶B1; AMPK: 腺苷酸活化蛋白激酶; mTOR: 哺乳动物雷帕霉素靶蛋白; PI3K: 磷脂酰肌醇3激酶; VHL: 林氏综合征; TIGAR: TP53诱导糖酵解和凋亡调节因子; PHD2: 脯氨酸羟化酶2; IKK: IκB激酶; NF-κB: 核因子κB; EGFR: 表皮生长因子受体; PTEN: 人第10号染色体缺失的磷酸酶及张力蛋白同源的基因; HER2: 人类表皮生长因子受体2; RTK6: 生长因子受体酪氨酸激酶6.