基础研究
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世界华人消化杂志. 2014-04-18; 22(11): 1495-1503
在线出版 2014-04-18. doi: 10.11569/wcjd.v22.i11.1495
表1 qRT-PCR引物列表
基因名称引物序列产物长度(bp)
Sp3F: 5'-GCTTGCACCTGTCCCAACTGTA-3' 148
R: 5'-CTCCAGAATGCCAACGCAGA-3'
Cyclin D1F: 5'-GGGCCACTTGCATGTTCGT-3' 149
R: 5'-CAGGTTCCACTTGAGCTTGTTCAC-3'
Cyclin E2F: 5'-TGGGAACTTTGTCCTGTAACAATCA-3' 200
R: 5'-CACAAGGCAGCAGCAGTCAGTA-3'
TGF-β1F: 5'-CGCATCCTAGACCCTTTCTCCTC-3' 133
R: 5'-GGTGTCTCAGTATCCCACGGAAAT-3'
CKI 2AF: 5'-TGAGGCGCCCTTTGGTTATC-3' 156
R: 5'-GAGGTTTCTCAGAGCCTCTCTGGT-3'
β-actinF: 5'-GCACCACACCTTCTACAATGAGC-3' 166
R: 5'-GGATAGCACAGCCTGGATAGCAAC-3'
表2 Sp3相关部分上调基因
NCBI基因号基因名称基因描述变化倍数P
1029 CDKN2A细胞周期蛋白依赖激酶抑制因子2A(黑色素瘤, p16, CDK4抑制因子) 2.2447672 0.0484199
604 BCL6B细胞慢性淋巴细胞白血病/淋巴瘤因子6(锌指蛋白51) 2.192251 0.0445856
5684 PSMA3蛋白酶体亚组, α型, 3 2.4935203 0.0036072
5710 PSMD4蛋白酶体26S亚组, 非ATP酶, 4 2.2616875 0.0004508
246184 CDC26细胞分裂周期因子26 2.8350668 0.0116091
7046 TGFBR1转化生长因子β受体Ⅰ (激活素A Ⅱ型受体样激酶, 53 kDa) 2.5749626 0.0311112
2296 FOXC1叉头框转录因子C1 2.364293 0.0034894
3265 HRASv-Ha-ras鼠Harvey肉瘤病毒致癌基因同源物 2.1287968 0.0021295
3429 IFI27干扰素α诱导蛋白27 2.8439498 0.0225853
27113 BBC3BCL2结合物3 2.2185693 0.049462
表3 Sp3相关部分下调基因
NCBI基因号基因名称基因描述变化倍数P
595 CCND1细胞周期蛋白D1 -2.107 0.047
9134 CCNE2细胞周期蛋白E2 -2.383 0.037
1027 CDKN1B细胞周期蛋白依赖激酶抑制因子1B(p27, Kip1) -2.764 0.024
1030 CDKN2B细胞周期蛋白依赖激酶抑制因子2B(p15, CDK4抑制因子) -2.302 0.037
4089 SMAD4SMAD家族成员4 -2.024 0.033
7040 TGFB1转化生长因子β1(Camurati-Engelmann病) -2.124 0.010
5155 PDGFB血小板源性生长因子β(v-sis类人猿肉瘤病毒致癌基因同源物) -2.249 0.004
7422 VEGF血管内皮生长因子 -2.181 0.020
1956 EGFR上皮生长因子受体(v-erb-b鸟类有核红细胞白血病病毒致癌基因同源物) -2.290 0.007
3488 IGFBP5胰岛素样生长因子结合蛋白5 -3.122 0.011
7157 TP53肿瘤蛋白p53(Li-Fraumeni 综合征) -2.192 0.012
5594 MAPK1丝裂原活化蛋白激酶1 -2.699 0.008
1499 CTNNB1连环蛋白β1(钙黏蛋白相关蛋白), 88 kDa -2.323 0.001
8313 AXIN2轴蛋白2(conductin, axil) -2.289 0.015
3725 JUNv-jun鸟类肉瘤病毒17致癌基因同源物 -3.517 0.002
表4 细胞周期时相分布 (%, mean±SD)
分组G1S期G2
空白对照组 62.50±4.00a10.38±2.82 27.10±1.20a
阴性对照组 59.75±3.85a14.65±1.69 25.05±5.25a
实验组 75.10±1.00 13.85±2.81 11.06±3.35

引文著录: 黄兰姗, 李海荣, 陈罡, 陆会平, 李佳, 冯振博. Sp3表达下调后肝癌细胞株HepG2基因表达谱的变化. 世界华人消化杂志 2014; 22(11): 1495-1503