应用基因芯片技术筛选肝细胞癌相关基因

表1 HCC组织中共同差异表达为上调的部分基因

功能分类	GenBank ID Log Ratio	基因名称	基因代码	染色体定位	Signal
抗氧化活性	NM_002083	谷胱甘肽过氧化物酶	GPX2	chr14q24.1	2.7
	NM_003330	硫氧还蛋白还原酶	TXNRD1	chr12q23	3.9
凋亡或肿瘤相关	NM_001467	v-myc	MYC	chr8q24.12	1.4
	NM_013250	r-ras癌基因同系物2	RRAS2	chr11p15.2	4.7
	NM_003350	死亡相关蛋白	DAXX	chr6p21.3	3.1
	AI582238	肿瘤排斥抗原	TRA1	chr12q24.2	2.1
结合蛋白相关	NM_012325	微管相关蛋白	MAPRE1	chr20q11.1	1.8
	NM_001903	细胞选择蛋白α1	CTNNA1	chr5q31	3.0
	NM_006396	核仁蛋白5A	NOL5A	chr20p13	1.6
代谢相关	NM_021299	醛酮还原酶	AKR1B10	chr7q33	1.7
	NM_002402	葡萄糖-6-磷酸脱氢酶	G6PD	chrXq28	6.4
	NM_003745	丝裂原活化蛋白激酶1	MAPK1	chr22q11.2	1.5
	NM_004396	RNA解旋酶	DDX5	chr17q21	2.1
细胞周期相关	NM_002786	细胞分裂周期2	CDC2	chr10q21.1	3.7
	NM_003237	细胞周期素 A2	CCNA2	chr4q25-q31	3.3
	NM_001592	增殖细胞核抗原	PCNA	chr20pter-p12	1.6
酶活性调节	NM_002734	cAMP依赖的蛋白激酶	PRKARIA	chr17q23	2.0
	NM_004039	钙结合蛋白A2	ANXA2	chr15q21	3.3
	NM_006241	蛋白磷酸酶1调节亚单位2	PPP1R2	chr2q29	1.6
分子马达相关	AF250307	细胞质动力蛋白	DNCI	chr2Q31.1	1.0
	BF432550	肌球蛋白IB	MYOIB	chr2q12	1.3
	NM_016141	细胞质动力蛋白多肽1	DNCLI1	chr3p23	2.0
营养储备相关	NM_005637	关节肉瘤	SS18	chr18q11.2	2.8
退化分子功能相关	AI761759	钙联接蛋白	CANX	chr5q35	1.3
	AU146237	剪接因子11	SFRS11	chr1p31	2.2
	U40763	亲环蛋白G	PPIG	chr2q31.1	2.2
信号传导相关	NM_007354	肿瘤相关钙信号转导物1	TACSTD1	chr2p21	4.8
	NM_001315	信号传导子及转录激活子1	STAT1	chr2q32.2	1.9
	NM_002875	胰岛素样生长因子1受体	IGF1R	chr15q26.3	3.9
结构分子相关	NM_005582	分泌型磷蛋白1	SPP1	chr4q21-q25	4.2
	NM_007227	层粘蛋白α3	LAMA3	chr18q11.2	3.7
	NM_001224	角蛋白18	KRT18	chr12q13	1.6
转录调控相关	NM_006315	信号传导子及转录激活子1	STAT1	chr2q32.2	1.9
	NM_014739	BCL2相关转录因子1	BCLAF1	chr6q22	2.0
	NM_001518	转录因子Ⅱ	GTP2L	chr7q11.2	1.4
翻译调控相关	NM_015904	真核翻译起始因子5B	EIF5B	chr2p11.1	4.0
	NM_004730	真核翻译起始因子1	EIF1	chr5q31.1	2.0
	NM_002453	线粒体翻译起始因子2	MTIF2	chr2p14	2.3
转运活性相关	NM_003100	分类连接蛋白2	SNX2	chr5q23	2.4
	NM_001444	脂肪酸结合蛋白5	FABP5	chr8q21.1	6.6
	AI816243	突触融合蛋白12	STX12	chr1p35	2.0

表2 HCC组织中共同差异表达为下调的部分基因

功能分类	GenBank ID Log Ratio	基因名称	基因代码	染色体定位	Signal
抗氧化活性相关	NM_000962	前列腺素内过氧化物合酶1	PTGS1	chr9q32-q33.3	-1.2
	BC001453	谷胱甘肽转移酶zeta1	GSTZ1	chr14q24.3	-3.4
凋亡或肿瘤相关	NM_000358	转化生长因子β1	TGFBI	chr5q31	-1.5
	X07868	胰岛素样生长因子Ⅱ	IGF-Ⅱ	chr11p15.5	-4.2
	NM_005538	抑制素βC	INHBC	chr12q13.1	-3.3
结合蛋白相关	X07868	胰岛素样生长因子Ⅱ	IGF-Ⅱ	chr11p15.5	-4.2
	NM_005125	超氧化物歧化酶铜伴侣蛋白	CCS	chr11q13	-1.7
	NM_002162	细胞间黏附分子3	ICAM3	chr19p13.3-p13.2	-2.7
代谢相关	M33318	细胞色素P450家族2, 亚科A, 多肽6	CYP2A6	chr19q13.2	-5.1
	NM_004563	线粒体磷酸烯醇丙酮酸羧激酶2	PCK2	chr14q11.2	-3.8
	NM_013267	肝线粒体谷氨酰胺酶2	GLS2	chr12q13	-4
细胞周期相关	NM_000592	补体成分4A/4B	C4A / C4B	chr6p21.3	-1.5
	N33167	周期素依赖性蛋白激酶抑制子1C	CDKN1C	chr11p15.5	-1.6
	NM_000064	补体成分3	C3	chr19p13.3-p13.2	-3.1
酶活性调节相关	NM_000125	雌激素受体1	ESR1	chr6q25.1	-3.2
	NM_021131	蛋白质磷酸酶2A, 调节亚单位B'	PPP2R4	chr9q34	-1.9
	NM_006944	分泌的磷蛋白2, 24 kDa	SPP2	chr2q37-qter	-4.7
	M13149	富含组氨酸糖蛋白	HRG	chr3q27	-1.7
分子马达相关	BF593594	驱动蛋白2	KNS2	chr14q32.3	-1.5
	X98507	肌球蛋白IC	MYO1C	chr17p13	-1.1
分子功能退化相关	NM_004343	钙网织蛋白	CALR	chr19p13.3-p13.2	-1.2
	NM_003097	核内小分子核糖核蛋白多肽N	SNRPN	chr15q11.2	-2.5
	NM_006275	富含精氨酸/丝氨酸胱硫醚γ-裂解酶-6	SFRS6	chr20q12-q13.1	-2.1
信号传导相关	X07868	胰岛素样生长因子Ⅱ	IGF-Ⅱ	chr11p15.5	-4.2
	NM_000358	转化生长因子β	TGFBI	chr5q31	-1.5
	NM_005538	抑制素βC	INHBC	chr12q13.1	-3.3
	NM_003227	转铁蛋白受体2	TFR2	chr7q22	-2.8
结构分子相关	NM_006097	肌球蛋白轻肽9调节子	MYL9	chr20q11.23	-1.8
	NM_007234	动力蛋白激活蛋白3	DCTN3	chr9p13	-1.6
	AY029208	VI型胶原α2	COL6A2	chr21q22.3	-1.6
	L27624	组织因子通道抑制剂2	TFPI2	chr7q22	-4.8
转录调控相关	NM_003195	转录延伸因子A2	TCEA2	chr20q13.33	-2.5
	NM_005693	细胞核受体亚科1, 组H, 成员3	NR1H3	chr11p11.2	-1.6
	NM_004364	CCAAT/增强子结合蛋白α	CEBPΑ	chr19q13.1	-2.7
	AI524138	转录因子EB	TFEB	chr6p21	-1.7
翻译调控相关	NM_003321	线粒体Tu·译延伸因子	TUFM	chr16p11.2	-2.1
	NM_001961	真核·译延伸因子2	EEF2	chr19pter-q12	-1.1
	AB014564	KIAA0664蛋白	KIAA0664	chr17p13.3	-2.2
物质运输相关	NM_006623	磷酸甘油酸脱氢酶	PHGDH	chr1p12	-4.1
	NM_000690	线粒体醛脱氢酶2家族	ALDH2	chr12q24.2	-2.5
	NM_002899	细胞视黄醇结合蛋白 1	RBP1	chr3q23	-3.1
	NM_000898	B型单胺氧化酶	MAOB	chrXp11.23	-2.5

表3 HCC组织中共同差异表达且具有多功能的部分基因

	GenBank ID	基因名称	基因代码	染色体定位	Signal Log Ratio
上调	NM_007315	信号传导及转录激活因子1	STAT1	chr2q32.2	3.1
	NM_004539	天冬酰氨酰-tRNA合成酶	NARS	Chr18q21.2	1.6
	NM_007145	锌指蛋白146	ZNF146	Chr19q13.1	3.0
	NM_002398	核仁磷蛋白	NPM1	Chr5q35	2.5
	NM_004501	不均一核糖核蛋白U	HNRPU	Chr1q44	1.6
	NM_003750	真核翻译起始因子3	EIF3S10	Chr10q26	1.8
	亚单位10θ
	AI582238	肿瘤排斥抗原	TRA1	Chr12q24.2	2.1
	NM_002734	cAMP依赖的蛋白激酶	PRKARIA	Chr17q23	2.0
下调	NM_002997	多配体1	SDC1	chr2p24.1	-1.8
	NM_021913	AXL受体酪氨酸激酶	AXL	chr19q13.1	-1.4
	NM_000029	血管紧张素原	AGT	chr1q42-q43	-1.5
	NM_004364	CCAAT/增强子结合蛋白, α	CEBPΑ	chr19q13.1	-2.7
	BC005174	转录激活因子5	ATF5	chr19q13.3	-2.3
	NM_000125	雌激素受体1	ESR1	chr6q25.1	-3.2
	NM_002567	前列腺结合蛋白	PBP	chr12q24.23	-2
	NM_006006	锌指和BTB 域封闭物16	ZBTB16	chr11q23.1	-1.9
	NM_002387	结肠直肠癌突变体	MCC	chr5q21-q22	-1.6
	X07868	胰岛素样生长因子Ⅱ	IGF-Ⅱ	chr11p15.5	-4.2