应用MS-RDA筛选胃癌甲基化差异片段

表1 MS-RDA所使用的接头及序列

接头名称	序列
RHpa Ⅱ24	5'-AGC ACT CTC CAG CCT CTC ACC GAC-3'
RHpa Ⅱ11	5'-CGG TCG GTG AG-3'
JHpa Ⅱ24	5'-ACC GAC GTC GAC TAT CCA TGA AAC-3'
JHpa Ⅱ11	5'-CGG TTT CAT GG-3'
NHpa Ⅱ24	5'-AGG CAA CTG TGC TAT CCG AGG GAC-3'
NHpa Ⅱ11	5'-CGG TCC CTC GG-3'
SHpa Ⅱ24	5'-ACT TCT ACG GCT GAA TTC CGC CAC-3'
SHpa Ⅱ11	5'-CGG TGT CGG AAT-3'

表2 MS-RDA分析所获得的差异甲基化片段的特征

片段	筛选 (次数)	长度 (bp)	GC (%)	CG/GC	相似性
					染色体定位	S	E	相似率 (%)
CRS1308	2	431	46.6	0.653 8	18q21.1-2	272	1e-69	86
CRS1309 (AY887106)	2	264	46.6	0.700 0	2p11.1	521	e-145	99
					1q21.1	498	e-138	98
					4p16.1	435	e-119	94
CRS1310 (AY887107)	2	395	50.6	0.928 6	8q13.3	745	0	98