镇江地区H. pylori的cagA基因及其3'可变区结构的变化

图1 部分H. pylori株cagA 3'端可变区的PCR扩增片段, 上、下游引物分别为Cag2和CagA 26R. M: 大小标识; 2: 临床株W259; 3: 国际标准菌株NCTC11 637; 4: 临床株W222; 5: 临床株W224; 6: 临床株W226; 7: 临床株W242; 8: 临床株W243; 9: 临床株W248

图2 部分镇江菌株CagA蛋白可变区的典型氨基酸序列. W23、W220、W24、W248、W173为来自镇江患者的H. pylori株. cagA基因可变区通过PCR扩增, 引物分别为cag2和cagA 26R, PCR产物纯化后测序. 11 637为国际标准H. pylori菌株, 其氨基酸序列通过检索Pubmed的Nucleotide数据库获得. W248菌株的氨基酸序列与NCTC11 637相似. 字母标注底色者, 为该菌株氨基酸序列中所含的EPIYA序列, 以及DDL序列和DFD序列; 字母标记黑框者, 为区分东西方菌株差异的KIASAGKGVGGFSGA和FPLKRHDKVDDLSKV序列